Krysy si stavějí hnízda na chráněných místech, kde se vyhýbají predátorům. Protože ve své domovině v Asii žijí krysy převážně na stromech, snaží se hnízda budovat vysoko nad zemí.
V domech žijí krysy ve vyvýšených prostorách, jako jsou půdy a podhledy, dutiny stěn a duté stropy. Vzhledem k tomu, že krysy mohou mít více hnízd, není odstranění jednoho z nich zárukou vyřešení problému.
Krysy si staví hnízda z papíru, textilu a izolace. Na dvorech také sbírají větvičky, trávu a další rostliny. Použijí téměř jakýkoli měkký materiál, který naleznou.